Нагойский Университет имеет тесное сотрудничество со следующими ВУЗами Узбекистана:


 Ташкентский государственный юридический университет и Нагойский Университет (2002)
 Университет мировой экономики и дипломатии и Нагойский Университет(2005)
 Самаркандский государственный университет и Нагойский Университет(2005)
 Академия государственного управления при Президенте Республики Узбекистан и Нагойский Университет (2014)

С 2000 года для претворения в жизнь межправительственных соглашений между Японией и Узбекистаном, а также для более широкого осуществления возможностей всестороннего позитивного использования интеллектуально-образовательного сотрудничества между двумя странами, подписан ряд соглашений с ведущими учебными заведениями Узбекистана: Академия государственного управления при Президенте Республики Узбекистан, Университет мировой экономики и дипломатии, Ташкентский государственный юридический университет, Самаркандский государственный университет.
Благодаря укреплению и развитию сотрудничества между Японией и Узбекистаном, узбекские и японские ученые на постоянной основе принимают участие в международных форумах, симпозиумах, круглых столах, которые организовываются как в Японии, так и в Узбекистане. На основе гранта правительства Японии узбекские студенты проходят обучение по специальной программе в магистратуре и докторантуре Нагойского университета и проводят исследования по различным актуальным направлениям права, политики, экономики, инженерии и др.
По уже сложившейся традиции, ежегодно, в августе студенты из Центра изучения японского права и языка участвуют в 2-х недельном студенческом семинаре, который организовывается Нагойским университетом. В целях закрепления полученных теоретических знаний, узбекские студенты были приглашены в банки, судебные и полицейские управления префектуры Аичи, в Ассоциацию адвокатов, побывали на ознакомительных встречах в мэрии г. Нагойи и городском Совете, посетили Министерство юстиции, Министерство образования, Верховный суд, Парламент, прокуратуру, налоговую инспекцию и Токийский университет.